Perform end-to-end single-cell sequencing workflows, including sample processing, single-cell dissociation, single-nucleus preparation, cell sorting, quality assessment, and library preparation.
Execute and optimize single-cell experiments using platforms such as 10x Genomics, PARSE, or other single-cell technologies.
Conduct molecular biology experiments including PCR, qPCR, nucleic acid extraction/purification, and NGS-related workflows.
Handle human and mouse tissue samples and optimize protocols for challenging samples to improve experimental performance and data quality.
Operate laboratory instruments including flow cytometers (FACS), cell counters, PCR/qPCR systems, and other molecular biology equipment.
Analyze experimental results, maintain accurate laboratory records, prepare reports, and communicate findings with internal teams and customers when required.
Troubleshoot experimental issues, improve laboratory workflows, and contribute to the development and validation of single-cell methodologies.
Collaborate with research teams and support the training or supervision of junior team members when needed.
Requirements
PhD degree in Cell Biology, Molecular Biology, Biotechnology, or related fields,
or a Master’s degree with 1–3 years of relevant hands-on laboratory experience.
Hands-on experience with single-cell sequencing platforms (10x Genomics or equivalent) and related experimental workflows.
Experience in:
Single-cell suspension preparation and tissue dissociation (human/mouse tissues)
Single-nucleus extraction/preparation
Flow cytometry/FACS operation
Molecular biology techniques including PCR, qPCR, purification, and NGS workflows
Experience with protocol optimization, troubleshooting, and laboratory SOPs.
Familiarity with organoids, recombinant AAV, screening, or low-input molecular assays is a plus.
Basic experience with data analysis tools (e.g., Prism, Spotfire, or equivalent) and interest in bioinformatics is preferred.
Good communication skills and ability to work collaboratively in a research environment.
Durchführung von **Single-Cell-Sequencing-Workflows von A bis Z**, einschließlich Probenverarbeitung, Einzelzell-Dissoziation, Einzelkernpräparation, Zellsortierung, Qualitätskontrolle und Library Preparation.
Durchführung und Optimierung von **Single-Cell-Experimenten** mit Plattformen wie **10x Genomics, PARSE** oder vergleichbaren Single-Cell-Technologien.
Durchführung molekularbiologischer Arbeiten, einschließlich **PCR, qPCR, Nukleinsäureextraktion und -aufreinigung** sowie weiterer NGS-bezogener Workflows.
Arbeiten mit **humanen und murinen Gewebeproben** sowie Optimierung von Protokollen für anspruchsvolle Proben, um die experimentelle Leistung und Datenqualität zu verbessern.
Bedienung und Wartung von Laborgeräten, insbesondere **Durchflusszytometern (FACS), Zellzählern, PCR-/qPCR-Systemen** und weiteren Geräten der Molekularbiologie.
Analyse und Dokumentation experimenteller Ergebnisse, Führung präziser Laboraufzeichnungen, Erstellung von Berichten sowie Kommunikation der Ergebnisse mit internen Teams und bei Bedarf mit Kunden.
**Fehleranalyse und Troubleshooting** bei experimentellen Problemen sowie kontinuierliche Optimierung von Laborabläufen und Mitwirkung bei der Entwicklung und Validierung von Single-Cell-Methoden.
Zusammenarbeit mit Forschungs- und Projektteams sowie bei Bedarf **Unterstützung bei der Einarbeitung und Betreuung von Junior-Teammitgliedern**.
Bereitschaft zu **gelegentlichen Dienstreisen**.
*Ihr Profil**
**Promotion (PhD)** in Zellbiologie, Molekularbiologie, Biotechnologie oder einem verwandten Fachgebiet **oder** ein Masterabschluss mit **1–3 Jahren einschlägiger praktischer Laborerfahrung**.
Praktische Erfahrung mit **Single-Cell-Sequencing-Plattformen**, idealerweise **10x Genomics**, sowie mit den entsprechenden experimentellen Workflows.
Praktische Erfahrung in folgenden Bereichen:
Herstellung von **Einzelzellsuspensionen und Gewebedissoziation** aus humanen und murinen Geweben
\*\*Extraktion und Präparation von Einzelkernen (Single Nuclei)\*\*
Bedienung von **Durchflusszytometern / FACS**
Molekularbiologische Methoden, einschließlich **PCR, qPCR, Nukleinsäureaufreinigung und NGS-Workflows**
**Protokolloptimierung, Troubleshooting und Erstellung bzw. Anwendung von Labor-SOPs**
Erfahrung mit **Organoiden, rekombinantem AAV, Screening-Verfahren oder Low-Input-Molekularassays** ist von Vorteil.
Grundkenntnisse in **Datenanalyse-Tools** wie Prism, Spotfire oder vergleichbaren Programmen sowie Interesse an **Bioinformatik** sind wünschenswert.
Gute **Kommunikations- und Teamfähigkeit** sowie Freude an der Zusammenarbeit in einem wissenschaftlichen Forschungsumfeld.
Sehr gute **Englischkenntnisse in Wort und Schrift**.
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